Фильм Ниндзя-убийца - это история Рейзо, профессионального ассассина, самого успешного и беспощадного в мире. Он был взят с улицы ребенком, выращен и превращен в неуловимого киллера клана Озуно. Но когда клан убивает его подругу, Рейзо сбегает от своих, чтобы отомстить. Он знакомится с агентом Европола Микой, которая расследует серию загадочных убийств, что превращает её саму в цель. Рейзо спасает Мику, чтобы вместе навсегда уничтожить клан Озуно.