В фильме Миссия Дарвина созданной гениальным ученым команде суперагентов спецназа морских свинок поручаются самые сложные правительственные задания, но однажды их списывают со службы, и свинкам приходится приспосабливаться к жизни в естественной среде. Но вскоре все меняется, и грызуны вынуждены спасать мир от захвата возжелавшим власти злодеем.